Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BgnP28653 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BgnP28653 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BgnP28653 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BgnP28653 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BgnP28653 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BgnP28653 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BgnP28653 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BgnP28653 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BgnP28653 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BgnP28653 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BgnP28653 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BgnP28653 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BgnP28653 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BgnP28653 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BgnP28653 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BgnP28653 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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