Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CftrP26361 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CftrP26361 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CftrP26361 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CftrP26361 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CftrP26361 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CftrP26361 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CftrP26361 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CftrP26361 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CftrP26361 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CftrP26361 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CftrP26361 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CftrP26361 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CftrP26361 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CftrP26361 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CftrP26361 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CftrP26361 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CftrP26361 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms