Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChgaP26339 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms