Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nfkb1P25799 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms