Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccnd1P25322 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccnd1P25322 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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