Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd247P24161 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd247P24161 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms