Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gja1P23242 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms