Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tap1P21958 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tap1P21958 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms