Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms