Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcaP20444 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms