Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VimP20152 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VimP20152 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VimP20152 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VimP20152 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VimP20152 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms