Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lama1P19137 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lama1P19137 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lama1P19137 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lama1P19137 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lama1P19137 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Lama1P19137 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lama1P19137 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lama1P19137 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lama1P19137 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Lama1P19137 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms