Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs2P17534 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms