Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rag1P15919 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms