Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vpreb2P13373 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms