Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Calb1P12658 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb1P12658 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms