Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa1P11477 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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