Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lamp1P11438 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms