Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd4P10628 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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