Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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