Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hoxc8P09025 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms