Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spta1P08032 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spta1P08032 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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