Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01878 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01878 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01878 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01878 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01878 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms