Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01648 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01648 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01648 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01648 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01648 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01648 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01648 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01648 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01648 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01648 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01648 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01648 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01648 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms