Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BlmO88700 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BlmO88700 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BlmO88700 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BlmO88700 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BlmO88700 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms