Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnk4O88454 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnk4O88454 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Kcnk4O88454 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnk4O88454 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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