Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AvilO88398 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AvilO88398 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AvilO88398 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AvilO88398 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AvilO88398 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AvilO88398 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AvilO88398 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AvilO88398 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms