Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cfdp1O88271 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cfdp1O88271 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms