Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col5a1O88207 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a1O88207 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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