Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SfnO70456 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SfnO70456 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SfnO70456 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SfnO70456 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SfnO70456 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SfnO70456 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SfnO70456 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SfnO70456 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SfnO70456 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SfnO70456 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SfnO70456 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SfnO70456 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SfnO70456 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SfnO70456 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SfnO70456 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms