Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms