Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtssO70370 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtssO70370 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtssO70370 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtssO70370 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtssO70370 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtssO70370 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtssO70370 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtssO70370 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtssO70370 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtssO70370 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtssO70370 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtssO70370 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CtssO70370 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms