Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms