Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgceO70258 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SgceO70258 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SgceO70258 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SgceO70258 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgceO70258 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgceO70258 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgceO70258 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SgceO70258 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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