Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Foxq1O70220 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Foxq1O70220 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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