Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chrna4O70174 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms