Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms