Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb3O54890 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms