Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NmbrO54799 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NmbrO54799 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NmbrO54799 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NmbrO54799 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms