Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms