Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Opn1mwO35599 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Opn1mwO35599 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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