Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clk4O35493 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk4O35493 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk4O35493 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Clk4O35493 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Clk4O35493 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Clk4O35493 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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