Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TnxbO35452 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TnxbO35452 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms