Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Abcc1O35379 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Abcc1O35379 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms