Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sprr3O09116 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sprr3O09116 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms