Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncoa3O09000 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms