Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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