Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17078M0QW51 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17078M0QW51 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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