Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm2035J3QP87 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm2035J3QP87 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms