Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm5294J3QP53 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm5294J3QP53 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm5294J3QP53 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm5294J3QP53 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm5294J3QP53 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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